Территория Гилгит-Балтистана граничит с Афганистаном на севере, с Китаем на северо-востоке, пакистанским государством Азад Джамму и Кашмир (AJK) на юге и управляемым Индией штатом Джамму и Кашмир на юго-востоке. Это несамоуправляющаяся территория под пакистанским контролем. Территория была ранее известна как Северные районы и является самым северным политическим образованием в контролируемой Пакистаном части бывшего княжеского штата Джамму и Кашмир. Территория стала единой административной единицей в 1970 году под названием «Северные районы» и была образована путем объединения Гилгит, Балтистанского района Ладакх Вазарат и штатов Хунза и Нагар. Перед независимостью Пакистана и разделением Индии в 1947 году Махарадж Хари Сингх распространил свое правление на Гилгит и Балтистан. После раздела Джамму и Кашмир в целом оставались независимым государством. Пакистанские части Кашмира к северу и западу от линии прекращения огня, установленной в конце индо-пакистанской войны 1947 года, или линии контроля, как ее стали называть, были разделены на северные районы (72 971). км ²) на севере и пакистанском штате Азад Кашмир (13 297 км ²) на юге. Название «Северные районы» впервые использовалось Организацией Объединенных Наций для обозначения северных районов Кашмира.
В регионе находятся одни из самых высоких горных цепей в мире - основными хребтами являются Каракорум и западные Гималаи. Памирские горы находятся на севере, а Гиндукуш лежит на западе. Среди самых высоких гор - К2 (гора Годвин-Остин) и Нанга Парбат, последняя является одной из самых опасных гор в мире. Три из самых длинных в мире ледников за пределами полярных регионов находятся в Гилгит-Балтистане - ледник Биафо, ледник Балторо и ледник Батура.
Климат Гилгит-Балтистана варьируется от региона к региону, окружающие горные цепи создают резкие колебания погоды. В восточной части есть влажная зона западных Гималаев, но при переходе к Каракоруму и Гиндукушу климат значительно сушит. В таких городах, как Гилгит и Чилас, летом очень жарко, но ночью холодно, а в таких долинах, как Асторе, Хаплу, Ясин, Хунза и Нагар, температура даже летом низкая.
Вдоль Каракорамского шоссе в Гилгит-Балтистане находится более 20 000 наскальных рисунков и каменных скульптур, сосредоточенных на десяти основных участках между Хунзой и Шалялом. Резные фигурки были оставлены различными захватчиками, торговцами и паломниками, которые проходили по торговому маршруту, а также местными жителями. Самые ранние датируются от 5000 до 1000 г. до н.э. и изображают одиночных животных, треугольных людей и сцены охоты, в которых животные крупнее охотников.
До 1978 года Гилгит-Балтистан был отрезан от Пакистана из-за сурового рельефа местности и отсутствия доступных дорог. Все дороги на юг были открыты в направлении контролируемого Пакистаном штата Азад Джамму и Кашмир (AKJ) и на юго-восток в направлении современного контролируемого Индией штата Джамму и Кашмир. Летом люди могли пройти через горные перевалы и отправиться в Равалпинди. Самым быстрым способом передвижения был воздушный транспорт, однако воздушный транспорт был доступен только нескольким привилегированным местным жителям, а также пакистанским военным и гражданским должностным лицам. Затем, при содействии правительства Китая, Пакистан начал строительство шоссе Каракорум (ККH), которое было завершено в 1978 году. Шоссе Каракорум (ККH) соединяет Исламабад с Гилгитом и Скарду, которые являются двумя главными узлами альпинистских экспедиций в Гилгит-Балтистан. Путешествие из Исламабада в Гилгит занимает примерно от 20 до 24 часов. Оползни на шоссе Каракорум очень распространены. KKH соединяет Гилгит с Такскорганом и Кашгаром в Китае через Суст (пункт таможенного и санитарного контроля на северной стороне) и перевал Хунджераб, самый высокий в мире международный пограничный переход на высоте 4693 м (15 397 футов).
Население состоит из множества различных языковых, этнических и религиозных групп, отчасти из-за множества изолированных долин, разделенных одними из самых высоких гор в мире. Урду является языком общения в регионе, понимаемым большинством жителей мужского пола. Язык шина (с несколькими диалектами) - это язык 40% населения, на котором говорят в основном в Гилгите, по всему Диамеру и в некоторых частях Гизера. На балтистанском диалекте, субдиалекте ладакх и входящем в тибетскую языковую группу, говорит все население Балтистана.